• L'ambiente delle acque sotterranee è caratterizzato dalla presenza di nicchie differenti che possono essere colonizzate da gruppi diversi di microrganismi.

• Alcuni microrganismi infatti, grazie alla loro potenzialità metabolica sono in grado di degradare una vasta gamma di inquinanti organici, come benzine, gasolio, oli combustibili, catrame, cianuri, solventi aromatici, e composti aromatici clorurati.

• La materia organica presente nel suolo, costituita da residui di piante, di animali e di microrganismi e da sostanze sintetizzate dagli organismi viventi nel terreno, svolge un ruolo centrale nel mantenimento delle funzioni chiave del suolo essendo un fattore determinante per la fertilità, per la resistenza all'erosione e per il mantenimento di proprietà quali il potere tampone e la capacità legante, che a loro volta contribuiscono a limitare la diffusione dell'inquinamento dal suolo all'acqua.